Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab5aQ9CQD1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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