Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms