Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a9Q99MR3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms