Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms