Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad3Q8BUN5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad3Q8BUN5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms