Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms