Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HltfQ6PCN7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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