Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx21Q3UR97 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx21Q3UR97 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms