Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cpne9Q1RLL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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