Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms