Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Hivep1Q03172 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hivep1Q03172 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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