Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddr1Q03146 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms