Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb4Q02738 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb4Q02738 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms