Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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