Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms