Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx1P70314 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx1P70314 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms