Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms