Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms