Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms