Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GdnfP48540 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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