Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TfamP40630 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TfamP40630 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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