Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms