Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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