Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
U2af2P26369 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms