Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd12P23812 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd12P23812 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd12P23812 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd12P23812 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd12P23812 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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