Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms