Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18524 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18524 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18524 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18524 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18524 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms