Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefmP08553 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefmP08553 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefmP08553 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefmP08553 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefmP08553 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefmP08553 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms