Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01810 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01810 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
P01810 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01810 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01810 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01810 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01810 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01810 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01810 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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