Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc6O88978 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrrc6O88978 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrrc6O88978 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc6O88978 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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