Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms