Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gp1baO35930 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1baO35930 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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