Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms