Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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