Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm3443F7CCV5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms