Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Igkv1-99F6XWB2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Igkv1-99F6XWB2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms