Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms