Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3095E9Q058 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms