Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcom1E9PZ54 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms