Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30bE9PVL6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms