Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc175E9PVB3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms