Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Palm3A2TJV2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Palm3A2TJV2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms