Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn15Q9JLG8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms