Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp5Q9JKD3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms