Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga3Q9JJZ8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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