Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mmp19Q9JHI0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp19Q9JHI0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp19Q9JHI0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp19Q9JHI0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp19Q9JHI0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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