Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SyncQ9EPM5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SyncQ9EPM5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms