Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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