Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms