Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
MceeQ9D1I5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MceeQ9D1I5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms